زمانی که ضریب درون‌آمیزی را محاسبه می‌کنیم باید نکات زیر را در نظر داشته باشیم.

1.تمامی مسیرهای ممکن باید شمرده شوند. یک مسیر به شرطی که گامت‌ها در آن جهت قابل انتقال باشند، ممکن است. مسیرهایی که قوانین وراثت را نقض می‌کنند در نظر گرفته نمی‌شوند.

برای مثال در شکل زیر مسیرI E D A D F I قابل قبول نیست.

2.در هر مسیر یک فرد تنها یک بار شمره می‌شود.

3.هر مسیر تنها یک جد مشترک می‌تواند داشته باشد. ضریب درون‌آمیزی افراد دیگر در یک مسیر بی‌اهمیت است.

در شکل زیر شجره‌نامه پیچیده‌ای را بررسی می‌کنیم که حاصل آمیزش بین خواهر و برادرها در هر نسل این الگوی شجره‌نامه بین حیوانات اهلی و حیوانات آزمایشگاهی دیده می‌شود. این شجره‌نامه دارای نکات جالب زیادی است.

1.چندین جد مشترک در چندین نسل متفاوت وجود دارد.

2.برخی از مسیرها پیچیده هستند (مسیرهای 6,5 ممکن است در وهله اول تشخیص داده نشوند)

3.هر چند در این شکل نشان داده شده است، یکی از جدها مشترک ، A ، حاصل از درون آمیزی است - این حقیقت را باید در مسیرهای 5,3 در نظر بگیریم.

ضریب درون‌آمیزی،F، یک جمعیت را به عنوان کاهش نسبی هتروزیگوت‌های جمعیت به علت درون آمیزی می‌توان محاسبه کرد. در مورد یک فرد F معادل با احتمال autozygot بودن است. در این مورد افزایش احتمال homozygot بودن همراه با کاهش احتمال هتروزیگوت بودن است در نتیجه با افزایشF برای هر فرد نسبت هتروزیگوت‌ها در جمعیت نیز کاهش پیدا می‌کند. براساس بیان بالا می‌توان F یک جمعیت را به صورت زیر محاسبه کرد:

در این موردHبرابر با نسبت واقعی‌ هتروزیگوت‌ها در جمعیت و 2pq معادل با نسبت مورد انتظار برای هتروزیگوت‌ها در جمعیت است که براساس تعادلHardy_Weinberg محاسبه می‌شود : این معادله را می‌توان به صورت زیر نوشت

این معادله نشان می‌دهد زمانی که H=2pq باشد F برابر صفر خواهد بود (زمانی که هیچ کاهشی در هتروزیگوت‌ها در نتیجه هیچ درون آمیزی وجود ندارد ) زمانی که هیچ هتروزیگوتی در جمعیت موجود نباشدF=1خواهد بود. این مورد برای یک جمعیت با درون آمیزی صددرصد، برای مثال گونه‌های گیاهی که خود باروری دارند صدق می‌کند.

یک مثال از وضعیت حدواسط : 100 نفر که دارای الل‌های در لوکوس A هستند را به عنوان نمونه از یک جمعیت انتخاب می‌کنیم. . در این مثال H=0.32,P=0.7,q=0.3 است.

از آنجایی که 2pq=0.42، و F=1-0.76=0.24 است در نتیجه ضریب درون آمیزی در این جمعیت معادل 24/0 است به این معنی که %24 کاهش هتروزیگوت‌ها به دلیل درون‌آمیزی است.