برخی از القاب امام نهم عبارت اند از: مختار، مرتضی، متوکل، متقی، زکی،
تقی، منتخب، جواد، عالم ربانی.
نام امام نهم علیه السلام محمد است و کنیه اش ابو جعفر. و چون نام امام باقر علیه السلام نیز محمد و کنیه اش ابو جعفر بوده، به امام نهم ابو جعفر ثانی میگویند.
منابع: مناقب، ج 4، ص 379.