یکی از منابع مهم استخراج احکام الهی قرآن کریم است، بلکه اصلی ترین منبع است، و برای استفاده از روایات نیز - بر اساس دستور خود ائمه علیهم السلام - باید ابتدا آنها را به قرآن عرضه نمود و اگر جنبه تعارض با آن را نداشت به آنها عمل نمود.
برای استخراج احکام الهی از قرآن نیز راه منحصر به خودش ارجاع آیات به یکدیگر است چرا که «
القرآن یفسر بعضه بعضا »؛ بعضی از قسمتهای قرآن مفسر بعضی دیگر است. بنابراین تنها کسانی می توانند برای استخراج احکام از قرآن مجید استفاده کنند که علاوه به دارا بودن علوم مقدماتی مثل دانستن ادبیات عرب و آگاهی به رموز سخن (علم معانی و بیان) و دانستن لغت نامه زمان نزول آیات و. . . . احاطه گسترده ای بر آیات قرآنی داشته باشند تا بتوانند با کنار هم چیدن آیات الهی حکم قرآنی را استخراج نمایند و به اصطلاح از
عام و خاص و
ناسخ و منسوخ و
محکم و متشابه و
ظاهر و باطن و. . . آیات مطلع باشند و آیات ناظر بر یکدیگر را به خوبی بشناسند.